根据中山市疾病预防控制中心（中山市卫生监督所）主要任务，内设机构24个，分别为：党委办公室、行政办公室、纪检室、财务部、质量与科教管理部、宣教部、公共卫生应急部、传染病预防控制部、免疫规划部、消毒与病媒生物预防控制部、艾滋病预防控制部、环境卫生与食品安全部、学校卫生部、慢性非传染性疾病预防控制部、基层卫生与地方病预防控制部、职业病监测评价部、微生物检验部、理化检测部、传染病防控监督部、公共卫生监督部、医疗执业监督部、妇幼健康监督部、职业卫生监督部、稽查协调部。